Strand-seqは当初、姉妹染色分体交換を開示するツールとして提案されました。個々の細胞に限局するアクションであるため、 DNA 複数の細胞のシーケンシングはこれらの効果を完全に分散させ、SCEイベントの不在を示唆します。さらに、古典的な単一セルシーケンステクニックは、不均一な増幅バイアスとデュアルストランド連結情報のためにこれらのイベントを表示できないため、ストランドseqが必要です。参照アライメント情報を使用して、継承されたテンプレートストランドの方向性が変化した場合、研究者はSCEを開示できます。
画像263A |ワトソン（W、緑）とクリック（C、青）の両方のストランドの読み取りカウントを表示する、BAITの出力。読み取られた各列挙棒は、参照ゲノムの特定の200 kbビンに位置合わせされた分析の数を示します。ここから、ペアレントテンプレートストランドの継承が推測されます。たとえば、娘細胞の200 kb染色体セグメントの両方のコピーが親細胞のWatsonテンプレートストランドから合成された場合、これは、その染色体領域の純粋なWアライメントを示す大きな緑色のバーで表されます。同様に、テンプレート鎖継承のホモ接合状態とヘテロ接合状態の切り替えは、姉妹染色分体交換（SCE）として解釈されます。 | Maia.smith / Attribution-Share Alike 4.0 International | Page URL ：（https://commons.wikimedia.org/wiki/File:Bioinformatic_Analysis_of_Inherited_Templates_(BAIT) from Wikimedia Commons _Output.png） from Wikimedia Commons
作者 : Yavor Mendel
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