用途と現在の研究

DRIP-seq は、Rループのゲノム全体のマッピングに自然に使用されます。特定 R-loop のサービスによって示されるように形成部位は、多様な細胞事象の研究を可能にする R-loop 特定の領域、これらの領域の特徴付け、および発現の遺伝子型の影響で形成。同様に、 DNA 複製や合成などの別のプロセスでのRループの影響を調べるために使用できます。間接的に、 DRIP-seq に関与する遺伝子を欠損変異細胞株に対して行うことができる R-loop 解決。これらのタイプの研究は、DNA-RNA形成の抑制における変異遺伝子の役割に密接に関連し、ゲノム不安定性におけるRループの重要性に密接に関連する可能性のある情報を提供します。

DRIP-seq は、ヒトのRループのゲノム全体のプロファイリングに最初に使用され、CpGアイランドプロモーターで広範囲の R-loop 形成を示しました。具体的には、研究者らは、 R-loop 形成がCpGアイランドの非メチル化状態に関連していることを発見しました。

DRIP-seq は後に、ヒト多能性Ntera2細胞のコピー開始点と終了点での R-loop 形成のプロファイルに使用されました。この研究で、研究者らは、遺伝子の3 '末端のRループがコピーの停止と相関している可能性があることを明らかにしました。

画像156A | R-loop およびS9.6モノクローナル抗体| Kmnip / CC BY(https://creativecommons.org/licenses/by/3.0/legalcode)| Page URL :(https://commons.wikimedia.org/wiki/File:R_loop_S9.6_mAb.svg)from Wikimedia Commons

画像156A | R-loop およびS9.6モノクローナル抗体| Kmnip / CC BY(https://creativecommons.org/licenses/by/3.0/legalcode)| Page URL :(https://commons.wikimedia.org/wiki/File:R_loop_S9.6_mAb.svg)from Wikimedia Commons

作者 : Yavor Mendel

参考文献:

分子生物学のテクニックI

分子生物学のテクニックIII

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