遺伝子サービスと相互作用

S. Cerevisiaeゲノムシーケンスと酵母ゲノムの90%をカバーする一連の削除変異体の可用性は、真核細胞の調節を理解するためのモデルとしてのS. Cerevisiaeの能力をさらに高めています。合成遺伝子アレイの精査を通じてすべての二重欠失変異体の遺伝的相互作用を分析するために進行中のプロジェクトは、この研究をさらに一歩進めます。目標は、セルのプロセスの機能マップを形成することです。

2010年の時点で、「出芽酵母のすべての遺伝子の約75%の相互作用プロファイル」を含む、遺伝的相互作用のモデルが最も包括的に構築されています。このモデルは、研究された遺伝子の各組み合わせについて二重遺伝子 knockout が実行された540万の2遺伝子比較から作成されました。セルの適合度に対する二重 knockout の影響を、予想される適合度と比較しました。期待される適合性は、単一遺伝子の適合性に関する結果の合計から決定されます knockouts 比較した遺伝子ごとに。予想とは異なるフィットネスがある場合、遺伝子は互いに相互作用していると推定されます。これは、結果を以前に知られているものと比較することによってテストされました。など、Par32、Ecm30、およびUbp15の遺伝子は、Gap1ソーティングモジュールの細胞作用に関与する遺伝子と同様の相互作用プロファイルを有していました。結果と一致して、これらの遺伝子は、ノックアウトされるとその作用を破壊し、それらがその一部であることを確認しました。

画像363A | Saccharomyces cerevisiae 。番号付きの目盛りは11マイクロメートル離れています。| ボブブレイロック/ Attribution-Share Alike 3.0 Unported | Page URL :(https://commons.wikimedia.org/wiki/File:20100911_232323_Yeast_Live.jpg)from Wikimedia Commons

画像363A | Saccharomyces cerevisiae 。番号付きの目盛りは11マイクロメートル離れています。| ボブブレイロック/ Attribution-Share Alike 3.0 Unported | Page URL :(https://commons.wikimedia.org/wiki/File:20100911_232323_Yeast_Live.jpg)from Wikimedia Commons

作者 : Allen Kuslovic

参考文献:

医療微生物学I:病原体と人間の微生物叢

ヒトの微生物相

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